Zum Beispiel ist das Taxon "Säugetieren" eine wahre Klade. Es umfasst den Vorfahren aller Säugetiere und aller Nachkommen. Das Taxon "Reptiles" ist eine paraphyletische Gruppe. Es umfasst den Vorfahren aller Reptilien und einige, aber nicht alle seiner Nachkommen. Vögel sind von dieser Gruppe ausgeschlossen, obwohl sie sich aus reptilischen Vorfahren entwickelt haben. Das Taxon "Wirbellose" ist eine polyphyletische Gruppe. Es umfasst Organismen von mehreren verschiedenen Vorfahren. Es umfasst alle Tiere, die keine Wirbeltiere sind.
Es ist wichtig, zwischen monophyletischen, paraphyletischen und polyphyletischen Taxa zu unterscheiden, da sie unterschiedliche Auswirkungen auf unser Verständnis der Evolutionsgeschichte haben. Monophyletische Taxa repräsentieren Gruppen von Organismen, die einen gemeinsamen Vorfahren haben und eine einzigartige evolutionäre Geschichte haben. Paraphyletische und polyphyletische Taxa repräsentieren keine Gruppen von Organismen, die einen gemeinsamen Vorfahren haben und eine einzigartige evolutionsgefügte Geschichte haben.