Lebensraumzerstörung: Der goldbraune Kapuziner bewohnt eine kleine geografische Reichweite, und sein Lebensraum wird durch Entwaldung ernsthaft bedroht. In Brasilien zum Beispiel, wo die meisten goldbrauen Kapuziner leben, wurden Wälder um bis zu 95%reduziert.
Klimawandel: Der Klimawandel wirkt sich auch auf goldbreichte Kapuziner-Lebensräume aus, da dies zu Änderungen der Temperatur- und Niederschlagsmuster führt. Diese Veränderungen können es den Tieren erschweren, Nahrung und Schutz zu finden und ihre Reproduktion zu stören.