Körperform: Platyhelminthen sind flach, während Nemathelminthen rund sind.
Körpersymmetrie: Platyhelminthen haben eine bilaterale Symmetrie, während Nemathelminthen eine radiale Symmetrie aufweisen.
Verdauungssystem: Platyhelminthen haben eine gastrovaskuläre Höhle, während Nemathelminthen ein komplettes Verdauungssystem mit einem Mund, einem Anus und einem Darm haben.
Nervensystem: Platyhelminthen haben ein einfaches Nervensystem mit einem Nervennetz, während Nemathelminthen ein komplexeres Nervensystem mit Gehirn und Nerven haben.
Fortpflanzungssystem: Platyhelminthen sind hermaphroditisch, während Nemathelminthen dioekious sind.
Lebensraum: Platyhelminthen sind sowohl in Süßwasser- als auch in Salzwasserumgebungen zu finden, während Nemathelminthen in Boden-, Süßwasser- und Salzwasserumgebungen zu finden sind.
Zusätzlich zu diesen Unterschieden unterscheiden sich Platyhelminthen und Nemathelminthen auch in ihren Lebenszyklen. Platyhelminthen haben typischerweise einen komplexen Lebenszyklus, an dem mehrere Wirte beteiligt sind, während Nemathelminthen in der Regel einen einfacheren Lebenszyklus haben, an dem nur ein Host beteiligt ist.