Die Pleistozän -Epoche war auch eine Zeit von Megafauna oder riesigen Tieren. Das größte dieser Tiere war der Mastodon, ein massiver Verwandter des modernen Elefanten, der Höhen von bis zu 13 Fuß erreichen und bis zu 8 Tonnen wiegt. Andere Megafauna, die zu dieser Zeit in Kentucky lebten, umfassten Mammut, Riesenbison, kurzgesichtige Bär und Dire Wolf.
Mit dem wärmenden Klima am Ende der Pleistozän -Epoche starben sich diese Tiere allmählich aus. Die letzten Mastodons verschwanden vor etwa 11.000 Jahren aus Nordamerika, während die letzten Mammuts vor etwa 10.000 Jahren ausgestorben waren.
Heute beherbergt Kentucky eine Vielzahl von Pflanzen und Tieren, die an das derzeitige Klima des Staates angepasst sind. Die Wälder werden von Eichen-, Ahorn- und Hickory -Bäumen dominiert, während die Graslands eine Vielzahl von Gräsern, Wildblumen und Sträuchern beherbergen. Die Tundra ist aus Kentucky verschwunden, aber im Staat ist immer noch eine Vielzahl von Tieren, die in kälteren Klimazonen wie dem Schneeschuhhase, dem roten Fuchs und dem Hirsch mit Weißwedeln enthalten sind.